亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：

在进行土地增值税清算的过程中，税务机关会对企业的各项成本费用进行严格的审核，尤其是关注合同流与发票流之间的一致性。如果其开票支付金额超过合同约定金额，若无合理解释，极大可能被税务机关认定为“虚增成本”，进而导致纳税调整。

《国家税务总局关于印发《土地增值税清算管理规程》的通知》（国税发〔2009〕91号）第二十一条第二款、第四款；第二十三条第一款；第二十五条第一款

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