C 公司开具代理费用发票应开给 A 公司。 原因如下：实际是 C 公司垫资与商签合同为 A 公司采购货物，虽然货款经 B 公司过账，但进口税费由 A 公司直接缴纳且进项税也由 A 公司抵扣，说明 A 公司是实际的采购方和货物接收方以及税费承担和进项税抵扣主体。C 公司的代理服务是为 A 公司提供的，因此代理费用发票应开给 A 公司。