土地增值税清算是按一二期清算，而不是整体清算。增值税清算应依照小区项目的实际发展情况即时清算，其原则是：清算期间内小区内的建设进度有按计划进行的，则在不同的建设阶段应分别清算；而如果小区内的建设工程超出了本次计划，则应将多次建设当做一次清算。 土地增值税清算要符合相关税收法规。按照《中华人民共和国国家税务总局关于土地使用税优惠政策有关问题的通知》，土地增值税清算应当采用时间段来清算。清算期间内，在影响房地产价格的建设工程达到规定要求时要进行一次清算，建设工程超出规定要求时要将多次建设当做一次清算。 增值税清算应当遵守税收法规，并给予适当的优惠，针对不同的清算期间适当审慎斟酌，有利于提高政府收入，促进经济发展。