土地增值税清算应按项目整体清算，在增值税改革中，政府出台了“增值税月度预缴制”，将从“预缴计算和报告”的角度出发，具体而言，在房地产开发企业建设的小区项目，其增值税的预缴及清算，应分别按建设的房屋及其他收入清算，且清算应针对整体项目来清算，不应按其一二期项目分别清算，即土地增值税清算应按项目整体清算。大量事实表明，凡是建设用地经过批准后，经开发利用建设的项目，其土地增值税应统一进行清算，且不再对其进行期次分期清算。 拓展知识： 政府出台“增值税月度预缴制”后，房地产开发企业可通过做出计算来确定自身的增值税额，在确定增值税的税额的同时，还应考虑税收优惠政策，包括房地产开发企业经营活动的免税，税额减半等。另外，在申报增值税的时候，需要对税务稽查范围内的所得确认其纳税义务，确保税收得以依法获取。