居民个人陈某为中国境内甲公司员工，本年取得收入情况如下： （1）每月取得中国境内甲公司支付的税前工资、薪金收入10000元。“三险一金”的计提基数为10000元，每月个人负担的养老保险、医疗保险、失业保险、住房公积金分别为：800元、200元、50元、800元，每月子女教育专项附加扣除额为2000元，每月赡养老人专项附加扣除额为2000元。 （2）为中国境内乙公司提供咨询全年取得税前劳务报酬收入共计40000元。 （3）出版小说一部，全年取得中国境内丙出版社支付的税前稿酬收入共计30000元。 （4）全年取得中国境内丁公司支付的税前特许使用费收入共计20000元。 甲公司、乙公司、丙出版社、丁公司已经为陈某预缴（代扣代缴）了个人所得税共计6000元。 要求： （1）计算陈某本年综合所得的应纳税所得额。 （2）计算陈某本年综合所得的应纳个人所得税。 (3)计算陈某本年综合所得汇算清缴时应补缴或申请退回的个人所得税。 三险一金是咋处理的