某公司是一家商贸企业，总部在上海，另在北京、广州有分公司，货物由仓储物流公司保管，每次他们需要货物向总公司要，由总公司向北京、广州分公司发货，然后由分公司自己管理自己的货物，但是分公司的销售由总公司统一入账，分公司其他的损耗总公司就不知道，所以对分公司的存货管理就失去了控制。应该如何对分公司的货物流转进行控制？