是的，如果公路项目的选线发生重大变化，需要重新报批环境影响评价文件。 根据《中华人民共和国环境影响评价法》和原环境保护部办公厅《关于印发环评管理中部分行业建设项目重大变动清单的通知》（环办〔2015〕52号），如果项目在施工图设计阶段因绕避地质灾害点、降低对既有线性基础设施和城镇规划的干扰等缘由，对部分线位进行了调整，这属于重大变动，应重新报批环境影响评价文件。