针对该情况，首先应该与客户沟通，妥善处理客户的维权问题，比如补发抵扣联或者协商以其他方式替代，以解决客户的问题。然后，应该相应的对税务局给予反馈，根据实际情况，及时报送具体说明给税局，申请补开发票，或者根据开票错误认定、退票、作废等相关税务处理手段来解决相关问题。此外，在快递运输中，员工应该更加注重把握好发票抵扣联的安全。 其次，建议采用电子开票等电子发票形式，以提高发票安全性，避免类似情况的发生。根据税收管理部门有关规定，一般企业经营活动应办理增值税电子普通发票，以确保发票的安全性。同时，发票的记录和保存应该放置在安全的地方，确保发票的完整性和有效性。