增值税专票两联在快递过程中丢失的情况下，销售方可以直接作废重开，但需要向税务机关说明丢失的原因，如果原因合理可以申请作废重开，必须提交一些有关凭证，比如快递签收单等，以证明快递丢失的情况。请求作废重开后，税务机关会对相关材料进行审核，通过审核后，销售方可以重新开具发票进行结算。 拓展知识:在增值税专票作废重开的情况下，销售方必须及时自行备案，及时向税务机关报送。如果发票存在其他问题，销售方必须自行承担因此发生的后果，不可以凭借作废重开名义免除责任。