陈女士当年应纳个人所得税税额的计算如下：根据《中华人民共和国个人所得税法》规定，陈女士应纳税所得额为40万元+2万元+3万元+4万元-5000元（子女教育专项扣除）-1500元（赡养老人专项扣除）-3000元（租金专项扣除）-280元（其他专项扣除），也就是44.48万元。 根据当年税率为3%﹣45%，应纳个人所得税金额为：44.48万元*3%＝1335.4元，减去速算扣除数1335.4元，则最终应纳个人所得税金额为0元。 拓展知识：个人所得税的算法是相对比较复杂的，会受到最高征税额、专项扣除、起征点等因素的影响。因此，要想准确地计算应纳个人所得税，就要熟悉这些基本因素，及其变化状况，并能够灵活运用。