亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
1.直接相关指的是该支出是为进行特定的研发活动而发生的，且与研发活动有直接的因果关系。
2.如果奖励张三5万元是因为他参与了研发项目，并对项目的成功做出了贡献，则可以算作直接相关的支出。
3.是的，全年一次性奖金通常被视为员工福利的一部分，不特指某项工作或活动，因此不能作为研发费用加计扣除计算基数。
4.发给专职研发人员的全年一次性奖金是否能加计扣除取决于该奖金是否与特定的研发项目紧密相关。如果能够证明这笔奖金是基于研发工作的绩效发放，则可能被允许加计扣除。
5.如果只发给专职研发人员的全年一次性奖金，并且可以提供证据表明这是对他们在研发活动中所做贡献的认可，那么这部分奖金有可能被视为直接相关的支出并进行加计扣除。判断理由包括但不限于：奖金发放标准、与研发活动的相关性证明等。
祝您学习愉快！