亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
问题1：因为是联营企业的话，甲公司对乙公司有重大影响，且持有的是重大经济利益，因此会因自身利益对独立性产生严重不利影响。

问题2：如果持有100股股票，不重大，这种情况下，虽然审计项目团队成员的妻子与乙公司之间存在经济利益关系，但由于持股比例不重大，这种关系可能不会被认为会对审计师的独立性产生严重的不利影响。然而，具体情况还需要根据其他因素（如乙公司在甲公司业务中的重要性等）来综合判断。
祝您学习愉快！