你好！**土地增值税扣除项目金额标准的指标表需要分开填写**。 对于分期开发的房地产项目，根据《国家税务总局关于房地产开发企业土地增值税清算管理有关问题的通知》规定，土地增值税的清算单位是以国家有关部门审批的房地产开发项目为单位进行清算的。这意味着，如果一个项目被分为若干个分期进行开发，那么每个分期项目都需要单独进行土地增值税的清算。 具体来说，在处理分期项目的清算时，应当以每个分期项目为单位来填写相应的土地增值税扣除项目金额标准的指标表。这样做可以确保每个分期项目的成本和费用都能得到准确的核算和扣除，从而合理计算出每个分期项目的土地增值税负担。