如果综保区外的一般纳税人公司进货发到综保区内企业，综保区内企业再出口到国外，只有区外公司可以申请出口退税。根据《财政部、国家税务总局关于出口货物劳务增值税和消费税政策的通知》（财税【2012】39号），出口企业或其他单位视同出口货物。具体是指出口企业经海关报关进入国家批准的出口加工区、保税物流园区、保税港区、综合保税区、珠澳跨境工业区（珠海园区）、中哈霍尔果斯国际边境合作中心（中方配套区域）、保税物流中心（B型）（以下统称特殊区域）并销售给特殊区域内单位或境外单位、个人的货物。视同出口的特殊区域不包括保税区，运入保税区的货物，如果属于出口企业销售给境外单位、个人，境外单位、个人将其存放在保税区内的仓储企业，离境时由仓储企业办理报关手续，海关在其全部离境后，签发进入保税区的出口货物报关单的，保税区外的生产企业和外贸企业申报退（免）税时，除分别提供规定的资料外，还须提供仓储企业的出境货物备案清单。 如果区内公司是区外公司的全资子公司，对退税没有影响。全资子公司是指只有一个法人股东的公司，其母公司可以通过两种方式来设立全资子公司：第一种是，从头开始成立一家新公司并修建全新的生产设备（例如工厂、办公室和机器设备等）；第二种是，收购一家现有的公司并将其设备纳为己用