对于6月底将增值税进项税额做平，实际申报却有余额的情况，可以在7月份入账时将这两张在6月抵扣的进项发票进行账务处理，同时调整相应的申报表。具体步骤如下： 1.重新计算6月份的应交增值税：根据6月份的销项税额和进项税额，重新计算6月份的应交增值税。如果应交增值税金额与已做平的账面金额存在差异，将差异部分调整到“应交税金-应交增值税（转出未交增值税）”科目中。 2.调整7月份的账务处理：对于7月份入账的两张进项发票，按照正常账务处理进行计入“应交税金-应交增值税（进项税额）”科目。同时，将该进项税额从“应交税金-应交增值税（转出未交增值税）”科目中转出，并计入相应的成本或费用科目。 3.调整申报表：根据调整后的账面数据，重新填写7月份的增值税申报表。申报表中的进项税额和销项税额应按照账面数据填写，并确保进项税额和销项税额的合计数与账面数据一致。 4.缴纳税款：如果申报表中有应交增值税金额，需要按照申报表中的金额进行缴纳。