首先，要计算个体工商户开票含税金额500万元需要缴纳的税费，必须先了解当地的税收政策，比如增值税、消费税、企业所得税等。 以增值税为例，对于500万元的发票，标明的税率由13%按照7种税率及减免政策确定，根据实际情况可分别缴纳如下税种： 1、增值税：根据个体工商户类别，施工项目，发票类型等，确定增值税税率； 2、消费税：对于服务行业中使用的货物和服务，需要缴纳消费税； 3、企业所得税：对于500万元的发票，企业应缴纳企业所得税； 4、个人所得税：注册的个体工商户，应该缴纳个人所得税； 以上税费可能存在差异，以具体的情况为准。以上是个体工商户开票含税金额500万元，需要缴纳的税费税种情况，具体税率及减免政策则需要根据当地的税收策略结合实际情况进行确定。 举个例子：某市一家个体工商户开票含税金额500万元，若确定为增值税的纳税人，其税率为13%，则应缴纳增值税65万元，消费税20万元，企业所得税20万元，个人所得税10万元，总计115万元的税费。