1、根据国家税务总局的税务政策，对于公司补缴上年度增值税，应当根据正常应纳税额和上年度实际纳税额的差额进行补缴； 2、根据财务部门的月度销售收入报表，总结出月度的应税销售额，以及应纳税额； 3、根据实际缴纳上年度税款报表，总结出实际纳税额； 4、比较上述两个报表，结合两年度的报表，计算出补缴的金额； 5、将财务人员录入的补缴数据，自动生成补缴申报书，并将补缴凭证，补缴申报书交至税务机关； 6、税务机关收到缴纳的补缴税款后，及时发放开具的发票，以及根据税收条款和条件发放补缴补贴、减免税等政策。 拓展知识：在纳税过程中，应注意遵守国家规定，避免漏缴税款，及时补缴上年度应缴税款，以及按照规定申报，以免产生滞纳金和罚款的情况。同时，企业还应充分利用国家的税收优惠政策，减少自身税费支出，提高企业的经济效益。