小规模纳税人不允许开零税率发票的原因，是因为根据《中华人民共和国营业税暂行条例》第十四条的规定：增值税小规模纳税人的销售额达到5万元以上的，需要按照正常税率缴纳税款，不得使用零税率发票。所以，小规模纳税人不能开零税率发票，以保证税收公正公平。 拓展知识：除了小规模纳税人不能开零税率发票，营业税暂行条例中，还规定了零税率发票的使用情况，即只有出口的增值税一般纳税人才能开零税率发票，其余情况都不允许开零税率发票。