是的，三方协议付款的分录是这样做的。做分录时，甲方先向乙方支付款项，用借：应付账款-甲方，贷：应付账款-乙方的方式做分录。付款时，用借：应付账款-乙方，贷：银行存款的方式做分录，乙方收到款项后，就完成了三方协议付款的分录。 再说明一点，在三方协议付款的时候，为了保证各方利益，通常会添加几项来保证分录的正确性。比如，要求有收据，乙方收到款项后要提供收据，乙方需要书面确认收到款项；另外，乙方还需要提供财务证明，明确收到的款项，比如账单、发票等，以作为分录的凭证。