如果独立核算的分公司跟总公司签订代发工资协议，年底结算给总公司，我认为是可行的，但是需要注意一些关键点。 首先，分公司和总公司需要明确签订代发工资协议，指定每个月结算给总公司的工资数量、时间、金额等，并且双方定期监督，确认工资支付准确率； 其次，分公司需要建立完整的财务管理制度，确保工资核发准确，并且分方需要定期向总公司报告工资发放情况，以确保双方的合规性。 最后，由于工资发放涉及到财务管理、社会保障、财政税收等方面，因此分公司和总公司需要遵从当地相关法律法规，以确保双方能够合法、合规地进行工资支付。 拓展知识：分公司在进行独立核算时，还需要严格遵守会计准则，合理进行账户的管理，包括财务报表的编制、账户账本的管理和账户的维护等，以保证财务报表的可信性和分公司的正常运作。