公司零申报处理的账务原则如下： 一、确定是否免税：如果有发票未抵扣或税率为零时，需要进行具体判断是否免税。一般有发票但未抵扣，则一般不会被认定为免税。但有发票而税率为零时，一般会被认定为免税。 二、分类记账：有发票未抵扣的应付账款，为非流动负债；有发票而免征税的收入，为非流动资产；如果有发票而免税，则可以记入本期利润和利润分配，但是要特别说明原因。 三、纳税义务处理：有发票未抵扣的应付账款，公司仍要按照发票金额进行申报缴纳；有发票而免税的收入，公司仍要进行报税，但可以免征税。 拓展知识： 关于零申报，还应注意另一方面，就是有时公司会在有发票的情况下，以零税额的形式进行税收处理。这样的情况一般是，公司在国家允许的情况下，可以准予不缴纳税收或缴纳低于规定金额的税收。比如，如果公司可以满足一定条件，可以申请小规模纳税人，那么公司可以根据国家规定，按部分收入申报零税额，从而减少纳税义务。