事业单位补发工资的账务处理需要按照财务规定进行处理，首先，需要按照当月财务账核对差异分析，确定差额的部分，然后开具工资补发单，发放补发的工资，再经过财务确认，记录在账务档案里。账务处理还需要根据劳动法律规定，分类合理缴纳社会保险费和个人所得税，以确保财务统一管理。 拓展知识：事业单位补发工资还应当遵守《企业会计准则》的规定，对补发工资的缴纳应当根据当前财务报表的准确性进行分类登记，并作好相应账务处理，确保财务合规管控。