答：没有总分关系的公司可以代发农民工工资，但需要签订代发协议书。代发协议书是指农民工把自己的工资款托管给代发单位，农民工可以要求代发单位及时、足额和准确的发放款项。农民工和代发单位双方签订的代发协议书，应当包括有关农民工工资发放款项的收支明细、结算方式以及代发单位的责任承担条款等内容。签订的代发协议书可以作为行政机关查证农民工发放工资款的法律依据，也是农民工从事劳动任务的依据。拓展知识：为了确保代发农民工工资程序的合法性、准确性，人力资源和社会保障部等有关部门还建议，代发农民工工资的企业应当做好管理，健全代发农民工工资的制度，加强账务管理和对账查证，落实偿付保证措施，加强农民工信息登记，建立规范的代发工资流程，确保代发的农民工拿到的工资足额、及时、准确。