解析：由于住宿费只能报1000元，可以认定住宿发票的进项税额1000元就是本次出差补助费用的全部税费，因此可以全部抵扣。 拓展知识：关于进项税额抵扣，根据《企业所得税法实施条例》规定，在报销时，对于符合下列情形的费用，当发票上的税额高于实际报销费用时，企业可以申请全额抵扣：本年度购买的机动车，当年发生的残疾人就业保障服务费，和发生的购买非增值专用发票费用。