某注册会计师2014年3月份完成了对A公司2013年度的财务报表审计工作。该公司的资产总额500万元，利润总额100万元。该注册会计师确定的财务报表层次的重要性水平为100万元。在审计中注册会计师发现如下情况：（1）2013年12月末A公司被控侵犯专利权，对方要求收取专利使用费以及罚款200万元，公司已提出辩护，此案正在审理中，最终结果无法确定。（2）2014年2月份A公司的某一仓库发生火灾，保险公司和A公司正在核定损失，该项存货经初步估计在300万元左右，A公司拒绝在财务报表附注中披露该事项及其影响。（3）A公司存货占资产总额50%的部分，因为位置和性质特殊，注册会计师无法实施监盘，且无法实施相应的替代审计程序。（4）A公司的应收账款总额为400万元，其中有270万元的应收账款注册会计师没有收到函证回函。同时由于A公司缺少相应的原始凭证，注册会计师也没有办法对此实施相应的替代审计程序。（5）注册会计师在阅读A公司的其他信息时，发现与已审计的2013年度财务报表存在重大不一致。注册会计师确定需要修改已审计的财务报表但遭到A公司管理层的拒绝，此时财务报表已提交给被审