有进项税有疑点，属于不能抵扣进项税的情形，该如何处理?

答：根据《财政部 税务总局关于进一步加大增值税期末留抵退税政策实施力度的公告》(财政部 税务总局公告2022年第14号)规定：“十二、纳税人取得退还的留抵税额后，应相应调减当期留抵税额。 　　

如果发现纳税人存在留抵退税政策适用有误的情形，纳税人应在下个纳税申报期结束前缴回相关留抵退税款。 　　

以虚增进项、虚假申报或其他欺骗手段，骗取留抵退税款的，由税务机关追缴其骗取的退税款，并按照《中华人民共和国税收征收管理法》等有关规定处理。”

所以，留抵退税160万中有5万进项税属于不能抵扣进项税的情形，属于存在留抵退税政策适用有误的情形的，纳税人应在下个纳税申报期结束前缴回相关留抵退税款。如果是以虚增进项、虚假申报或其他欺骗手段，骗取留抵退税款的，由税务机关追缴其骗取的退税款，并按照《中华人民共和国税收征收管理法》等有关规定处理。