分包合同的开票应当以差额征收的方式开具发票，这样就不用再支付额外的税款了。另外也要注意，分包合同属于一种联营合同，如果是两个以上的单位分别参与合作，每个单位间的责任、报酬、费用都要根据实际情况确定，在联营合同中，每个参与者都有利润。拓展知识：在分包合同的签订过程中，每一方都应该考虑到自己的利益，充分考虑风险，并明确各方责任和义务，以确保双方签订的合同更加具有法律效力。