企业合同销售增值税的发票处理步骤如下： 1.确定开票条件：根据发票法规定的开票条件，确定发票的开具时机，以及开票所需的税务信息等。 2.准备开票资料：收集相关的发票开具资料，如客户单位的税务信息，开票金额，开票抬头，发票内容等。 3.开具发票：通过专业的发票软件，按照相关开票要求，申请开具发票。 4.销售确认：将已开具的发票，发送给客户，并要求客户确认，客户确认后，记录发票的开具信息。 拓展知识：发票处理过程中要注意的是，发票应当做到真实、准确、完整，不得进行假开、故弄玄虚等行为，违法行为将受到有关税务部门的违法处理。