如果甲方只回款700元，扣工程款300元，用于直接支付了咨询费用的情况，请考虑下面的处理办法： 首先，我们必须进行资金调整，将开票金额1000元和实际收入为700元进行对账，以保证我们的账务准确。记账方面可以采取以下处理：先将票据金额为1000元，在应收账款中增加1000元，然后将实际收到的700元，从应收账款中减去，另外还要给予甲方相应的咨询费用支出报销，记账形式如下，应收账款1000元 减去应付账款300元，得净收入700元，也就是最终的实际收入。 此外，在处理上述财务状况的同时，建议考虑制定一个完善的收款管理机制，包括定期跟踪未付款情况、执行客户收款计划、及时发现回款过少或过多的情况以及严格的客户额度管理机制。这可以有效预防上述情况的发生，降低财务风险，保障我们的资金安全。 总之，针对上述财务问题，必须采取有效措施来处理，以确保资金准确性和账务可视性，并加强财务管理，以避免这类财务风险的发生。