小规模纳税人在一季度开了一张1%的专票，二季度开了一张3%的专票，由于两次开票发票税率不一致，所以税额查2%，应当将2%的税额分别填写在1%和3%的发票税额栏上，且分别补足至一致。同时，2%的税额应当填写在报表里冲当期收入，以避免电子税务局税额比对不符的情况发生，以保证增值税费用的准确性。 为了更加准确的处理发票的税额，小规模纳税人应当关注政府最新出台的政策，及时了解最新出台的相关税率，发票填写正确、合规，以免影响纳税人的正常交税业务。