外贸公司需要申报的进项税的税额，是按照客户支付的21万这笔款项来计算的。1万的佣金不加入计算税额，我们需要把收到的1万佣金，通过公司特殊账号，进行转账，不参与税额计算和码头等收入，也不用于纳税。这也是为了避免报税时，出现税款抵扣不到，导致外贸公司税务方面的风险出现。 这也是为了让外贸公司正常进行管理和报税，以及让公司的金融活动更加透明和规范。此外，公司可以充分利用这种1万的佣金，可用于约定的目的范围内，进行更多的投资，开发新的项目，以及进行总部的管理活动等。这样不仅能够有效避免税收方面的纠纷，也能更好地保障公司的财务安全，增加公司的经营效益。