对于取得的苗木普通发票可以抵扣增值税销项税额，但是此类发票并不能成为免税凭证，也不能作为抵扣购买苗木所征收的税款，只有取得增值税专用发票才有可能抵扣增值税销项税额。抵扣具体流程是: 1.企业先在增值税专用发票上开具17%的税率，确保发票的完整性； 2.从销项发票中获取6%的税率，并将17%和6%的税率进行比较，取较大的那一方作为抵扣增值税金额的基础； 3.在增值税专用发票上填写付款信息，发票就变得有效； 4.将发票交予税务机关进行登记，登记完成之后即可完成抵扣增值税费用。 此外，企业在开具苗木发票时务必填写详细信息，以便确认有效性，由于苗木发票可能包含多项业务，而每项业务会有不同的税率，所以及时填写发票中的税率信息也是一个重要环节。 拓展知识：在增值税专用发票上开具的税率有17%、13%、11%、6%四种，17%的税率适用的是批发销售，13%的税率适用于服务销售，11%的税率适用于建筑、安装、维修服务等，而6%的税率适用于住宿、旅游服务等。