答案是不行的。首先，根据《中华人民共和国税收征收管理法》和《销售税收管理办法》的规定，开具增值税发票需要应税服务或者销售货物的实际成交价格为标准。而如果预付货款1000元，在交易全部结束之前，由于退货100元，所以从实际上来看，只有900元是有效的成交价格，必须按照900元来开发票，而不是按照1000元开发票。 此外，还需要注意的是，当发票出现差错时，开票方应及时补开有效发票，而不可销售方收到发票差错信息后，要及时将发票报送税务管理机构进行登记，再及时与开票方申请补开发票，以保证自身在税收事宜上的正确性。