按照6月份实际开具的发票金额来计算，那么应该报6月份增值税1000元，不包括7月份冲红的100元发票。因为增值税的计算要求是以实际开票的金额为准，而不是根据后期的发票冲红情况来计算。 此外，纳税人在日常经营活动中，在7月份进行冲红，需要等到税收归属期结束后，才可以根据相关发票情况，提出申请销售未计算增值税，由税务机关核实后，按照规定进行相关处理。