根据《合同法》的规定，合同是双方可认可的书面形式，具备双方必要权利义务表述，并经双方签字盖章认可而成立法律效力的一种文件，双方应共同履行合同义务，但对待开票备注之事，如果分包发票是按合同上的工程名称备注的，那么有关开票备注的问题并不会影响双方的权益，因为两个项目分别属于不同的施工许可证，只要满足合同所规定的权利义务，不会影响合同的生效性。此外，我们还应留意，施工许可证的设立，是有政府行政部门对施工项目的审批，针对一定类型的施工项目，经审批后，产生效力，仅此一种施工项目才有资格应用，以保证施工项目的合法性，以避免不必要的法律纠纷。