公司员工可以再申请一个个体户，可以和公司进行业务往来，但是必须要做好隔离措施，要求个体户和公司之间的财务往来不能混淆，并且每月缴纳税款，出入应当进行充分的记账和凭证。由于个体户是一种小规模经济活动，规模小，投资小，受环境影响较小，税收较低，秩序较为混乱，所以在税务局审核的时候，要求公司员工个体户往来资金明细账本及购销凭证等信息必须一致，以确保公司和个体户往来账款有序。 拓展知识：个体户一般是指具有独立法律地位的合法经营主体，是一种小规模经济活动，以个人名义进行生产经营的活动。自从税务征管个体户出台之后，个体户除了要按照纳税规定缴纳税款外，他们还有责任建立税务专用帐户，并且要定期报告经营业绩，维护纳税稳定，促进经济的健康发展。