税务申报问题，最近出的《增值税发票综合服务平台》有了针对单张专票的有效税额之说；我司收到供应商专票一张，票面金额、税额开多，且供应商不给重开；因此我在《增值税发票综合服务平台》针对这张发票填了有效税额，之后统计确认也是没有问题。现在我司税务人员在申报抵扣比对时出现“《附列资料二》第2栏‘本期认证相符且本期申报抵扣’金额、税额数据与发票数据不符”的情况，而这个差额正是供应商多开而我没有有效确认的金额，请问这种情况应该如何处理？不胜感激！