亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
根据您提供的信息，公司使用员工个体工商户账号开普票，且业务是真实存在的，这种情况可能存在虚开的风险。虚开发票是指开具与实际经营业务不符的发票，或者在没有真实交易的情况下开具发票。虽然业务是真实的，但是个体户与公司没有实际的流水，这可能会引起税务机关的怀疑，认为存在虚开行为。

祝您学习愉快！