1.东兴公司治理结构设计存在一处不合理的地方。

即：公司监事会不能隶属于公司董事会。因为治理结构要求，公司的决策机构、执行机构和监督机构要相互独立、权责明确、相互制衡，监事会对股东会负责。所以，公司监事会应与董事会一样，隶属于股东会。

2.东兴公司内部机构设计存在两处不合理的地方。

即：（1）审计部不能划归总会计师分管。因为内部控制要求企业要保证内部审计机构设置、人员配备和工作的独立性。所以，审计部应隶属于公司董事会或监事会领导。

（2）仓储部不能划归主管经营副总经理分管。因为仓储部在存货入库、出库等方面都对采购部、销售部形成制衡关系，采购、销售和仓储同归一个领导管理，就必然缺乏必要的制衡。所以，仓储部应该划归总经理直接分管。