在你描述的场景中，如果员工报销的金额已经以现金支付，那么在账务处理上应该做如下处理：借记“管理费用”或者具体的费用科目（如“差旅费”、“交通费”等），贷记“库存现金”。这样的处理反映了公司以现金形式支付了员工的报销费用。之前的代理记账所用的“应付账款-某某公司”可能是指向特定供应商或服务提供者的账款，如果已结清，应相应调整。