排污许可证的持有者需要申报环境税。 根据《中华人民共和国环境保护税法》的规定，直接向环境排放应税污染物的企业事业单位和其他生产经营者为环境保护税的纳税人，应当依照本法规定缴纳环境保护税。这里的应税污染物包括大气污染物、水污染物、固体废物和噪声等。因此，持有排污许可证的企业，作为直接向环境排放应税污染物的主体，无疑需要缴纳环保税。