当个体户增值税申报出现上述问题时，可以按照以下步骤进行处理： 一、检查数据准确性 核对《增值税减免税明细表》中 “3 减 1” 项目的本期发生额计算是否正确。 确认税控系统开具征收率为 1% 的增值税专用发票和增值税普通发票不含税销售额合计是否准确，可通过查询税控系统开票记录进行核对。 按照要求，本期发生额应为上述不含税销售额合计乘以 2%。重新计算本期发生额，看是否与申报数据存在差异。 二、修改申报数据 如果经检查发现申报数据确实有误，应根据实际情况进行修改。 进入增值税申报系统，找到《增值税减免税明细表》相关项目进行修改。 将 “3 减 1” 项目的本期发生额按照正确的计算结果进行调整，确保与开票数据和政策要求相符。 三、重新申报 修改完申报数据后，再次进行申报比对。 仔细检查申报系统中的提示信息，确保所有比对项目都通过。 如果仍有问题，可根据提示进一步排查和修改，直至申报成功。