单位不能开具运输费发票给分包单位。 关于开票权限： 企业只有在其经营范围之内的业务才能开具相应的发票。如果单位的经营范围不包括运输服务，那么就不能开具运输费发票。 关于进项税转出： 进项税转出是因为该发票对应的业务不是用于应税项目或者不符合抵扣条件等原因而进行的税务处理。一旦进行了进项税转出，不能因为要给分包单位开发票就将转出的进项税要回来。 如果分包单位需要运输费发票，应该由运输单位直接开具给分包单位或者运输单位开具红字发票冲销原发票后再重新开具给分包单位（需符合相关税务规定和流程）。而单位应按照正常的结算流程，与分包单位明确已垫付运费的处理方式，避免税务风险和纠纷。