关于农民工工资个税申报问题： 如果劳务公司与农民工存在雇佣关系，一般情况下应由劳务公司代扣代缴农民工工资的个人所得税。 如果劳务公司将劳务分包给其他单位或个人，而这些单位或个人又雇佣了农民工，那么根据具体情况，可能由实际雇佣农民工的单位或个人代扣代缴个税。 在甲方代发农民工工资的情况下，甲方一般不负责代扣代缴个税。除非有特殊约定或法律规定甲方承担此责任。 关于付款委托书的出具方： 如果是建筑公司直接雇佣的农民工，且甲方要求代发工资，那么付款委托书应由建筑公司出具。 如果农民工是由劳务公司雇佣的，且甲方要求代发工资，那么付款委托书应由劳务公司出具