根据相关法律法规，劳务公司在代发农民工工资时，必须要依法申报，缴纳相关税收，如就个人代开劳务发票而言，个人本身并不具备开具发票税负，因此劳务公司仍需对农民工工资使用发票进行税收缴纳。另外，农民工本身也应当在发票抵税时，依法申报税款，参与社会保险，并应当将其所得合规处理。 另外，在劳务公司发放工资的过程中，应同时建立工资清单，明确农民工的姓名、身份证号码、纳税人识别号、税收居民起止日期等，并且将农民工所得收入以及扣缴的个人所得税记录在工资清单中，以便税务管理部门查询。 总之，劳务公司在发放农民工工资时，应当依法申报，缴纳相关税收。农民工本身也有义务缴纳个人所得税，并将其所得是放进合规渠道。劳务公司在此过程中，应当将农民工的身份信息及工资所得收入等信息记录清楚，以便税务部门进行审核。 拓展知识：根据相关征税政策，劳务公司发放的工资，农民工仍需要缴纳住房公积金、社会保险费等。同时，农民工也有权享受财政专项扶贫和低保等社会救助政策，实现农民工可持续发展。