1.对于商超外购免税农产品的进项税额计算：商超购进免税农产品是有进项税额的。如果取得了农产品收购发票，进项税额按照收购发票上注明的买价乘以扣除率来计算。 2.计算进项税额的公式和依据：进项税额 = 买价×扣除率。目前，农产品的扣除率一般为 9%。如果用于生产销售或委托加工 13%税率货物的农产品，在领用当期还可以加计扣除 1%。 3.本题中进项税额的具体计算：已知收购发票上注明价款为 6 万元，这里的 6 万元就是买价。进项税额 = 60000×9% = 5400 元。 所以，商超外购免税农产品有进项税额，在本题中进项税额是 5400 元。