（1）纳税人进行土地增值税清算的政策依据主要包括《中华人民共和国土地增值税暂行条例》及其实施细则等相关法律法规。符合以下条件之一的，纳税人应进行土地增值税的清算：①房地产开发项目全部竣工、完成销售的；②整体转让未竣工决算房地产开发项目的；③直接转让土地使用权的。 （2）房地产开发企业销售该项目的不含税收入 = 54500÷(1 + 9%) = 50000（万元） 增值税销项税额 = 50000×9% = 4500（万元） （3）取得土地使用权所支付的金额 = 12000×(1 + 4%) = 12480（万元） 开发成本 = 9000 - 650 = 8350（万元） 允许扣除的开发费用 = (12480 + 8350)×10% = 2083（万元） （4）与转让房地产有关的税金及附加 = 150 万元 加计扣除 = (12480 + 8350)×20% = 4166（万元） 扣除项目金额合计 = 12480 + 8350 + 2083 + 150 + 4166 = 27229（万元） 增值额 = 50000 - 27229 = 22771（万元） 增值率 = 22771÷27229×100% ≈ 83.66% 土地增值税额 = 22771×40% - 27229×5% = 7796.95（万元）