在汇算清缴时，职工福利费、补充养老保险费和补充医疗保险费不能直接加计扣除并算进研发费用，而高企也不算入的原因是，这些费用有其特定的税前扣除规定。 根据相关政策，企业为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，在不超过职工工资总额5%标准内的部分，准予在计算应纳税所得额时扣除；超过的部分，不予扣除。 而研发费用加计扣除政策有其明确规定的范围。比如人员人工费用包括直接从事研发活动人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘研发人员的劳务费用。但需要注意的是，职工福利费、补充养老保险、补充医疗保险不属于人员人工费用，应按规定列入其他相关费用，并采取限额扣除的方式。