在新公司法的规定下，对于自然人股东，公司减资视同回购且企业正常经营且有盈利的情况下，自然人股东的股权转让收入通常按照以下原则确定： 股权转让收入一般根据公司净资产情况来确定。公司净资产等于公司资产减去负债后的余额。 如果公司有健全的财务核算，且账目清晰，股权转让收入可以按照减资时公司经审计的净资产乘以股东的持股比例来计算。 例如，公司减资时经审计的净资产为 1000 万元，自然人股东持股 20%，则该自然人股东的股权转让收入为 1000 万元×20% = 200 万元。 但如果公司财务核算不健全，无法准确核算净资产，税务机关可能会采取核定的方式来确定股权转让收入。