这样操作存在一定的不合规风险。租房合同是员工个人跟中介公司签订的，而公司公户付款并要求中介开发票，可能导致发票抬头与合同主体不一致。 从合规的角度来看，建议将租房合同改为公司与中介公司签订，这样可以保证合同主体、付款方和发票抬头的一致性，避免潜在的税务和法律问题。 如果由于某些原因无法更改合同主体，公司可以与员工签订一份内部协议，明确员工代表公司与中介公司签订合同的事宜，并规定相关的费用报销和责任承担方式。同时，公司应保留好相关的付款凭证、合同和发票等文件，以备可能的税务审查。 根据《企业所得税法》和相关规定，企业为职工提供住宿而发生的租金支出，可以作为职工福利费在企业所得税前扣除。但需要注意的是，职工福利费的扣除有一定的限制和要求，具体应根据当地的税收政策和法规进行处理。